Seu companheiro de Red Bull, Max Verstappen, ficou na segunda posição, anotando 0s101 a mais que Pérez.
A Ferrari veio logo na sequência, com Carlos Sainz em terceiro e Charles Leclerc em quarto. A duplas da Mercedes (Lewis Hamilton e Valtteri Bottas) não ficou nem no top 10.
Completando a lista dos 10 primeiros, Pierre Gasly foi o quinto mais rápido, seguido por Fernando Alonso. Antonio Giovinazzi, Lando Norris, Esteban Ocon e Yuki Tsunoda fecharam a sequência.
Os pilotos voltam às pistas de Baku nesse sábado às 6 e 9 horas (de Brasília), para o terceiro treino livre e o classificatório.